Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tsg101Q61187 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tsg101Q61187 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tsg101Q61187 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms