Protein–RNA interactions for Protein: Q61120

Shc3, SHC-transforming protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc3Q61120 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shc3Q61120 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc3Q61120 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc3Q61120 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms