Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ift20Q61025 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ift20Q61025 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ift20Q61025 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms