Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rbbp7Q60973 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rbbp7Q60973 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms