Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rbbp4Q60972 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rbbp4Q60972 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rbbp4Q60972 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms