Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r1bQ60829 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ppp1r1bQ60829 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ppp1r1bQ60829 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ppp1r1bQ60829 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms