Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csnk2a1Q60737 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csnk2a1Q60737 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk2a1Q60737 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms