Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SkiQ60698 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SkiQ60698 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SkiQ60698 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms