Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HnrnpdQ60668 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HnrnpdQ60668 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HnrnpdQ60668 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms