Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm2aQ60648 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm2aQ60648 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm2aQ60648 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms