Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CttnQ60598 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CttnQ60598 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CttnQ60598 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms