Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tdrd5Q5VCS6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tdrd5Q5VCS6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms