Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Specc1Q5SXY1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Specc1Q5SXY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Specc1Q5SXY1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms