Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ankrd40Q5SUE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ankrd40Q5SUE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ankrd40Q5SUE8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.3 ms