Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.6 ms