Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TefmQ5SSK3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TefmQ5SSK3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TefmQ5SSK3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms