Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC97

Vmn1r209, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r209Q5NC97 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Vmn1r209Q5NC97 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r209Q5NC97 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r209Q5NC97 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms