Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ttf2Q5NC05 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttf2Q5NC05 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttf2Q5NC05 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms