Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8N4

Sdr39u1, Epimerase family protein SDR39U1, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr39u1Q5M8N4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sdr39u1Q5M8N4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sdr39u1Q5M8N4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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