Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nlrc3Q5DU56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrc3Q5DU56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrc3Q5DU56 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms