Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Syce1lQ5D525 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1lQ5D525 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms