Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms