Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp13Q5BKP2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp13Q5BKP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms