Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf354cQ571J5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znf354cQ571J5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znf354cQ571J5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms