Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc84Q4VA36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc84Q4VA36 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc84Q4VA36 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms