Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Shank3Q4ACU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shank3Q4ACU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Shank3Q4ACU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Shank3Q4ACU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms