Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc110Q3V125 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc110Q3V125 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms