Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
4930596D02RikQ3V0H9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms