Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rimbp3Q3V0F0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rimbp3Q3V0F0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rimbp3Q3V0F0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rimbp3Q3V0F0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms