Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bbof1Q3V079 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bbof1Q3V079 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbof1Q3V079 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms