Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttc9Q3V038 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ttc9Q3V038 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ttc9Q3V038 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc9Q3V038 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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