Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tbc1d9Q3UYK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tbc1d9Q3UYK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tbc1d9Q3UYK3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms