Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm12888Q3UW77 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms