Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Klhdc9Q3USL1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Klhdc9Q3USL1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Klhdc9Q3USL1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms