Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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D13Ertd608eQ3UPR8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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