Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prrc1Q3UPH1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrc1Q3UPH1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrc1Q3UPH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms