Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rmi2Q3UPE3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rmi2Q3UPE3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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