Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Skap2Q3UND0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skap2Q3UND0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skap2Q3UND0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms