Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ankrd27Q3UMR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms