Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB5

Smcr8, Guanine nucleotide exchange protein SMCR8, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smcr8Q3UMB5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smcr8Q3UMB5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smcr8Q3UMB5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smcr8Q3UMB5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms