Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ceacam12Q3UKP4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ceacam12Q3UKP4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms