Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc61Q3UJV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc61Q3UJV1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms