Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mier3Q3UHF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Mier3Q3UHF3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mier3Q3UHF3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms