Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD2

Gfod1, Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfod1Q3UHD2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gfod1Q3UHD2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfod1Q3UHD2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms