Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lrrc58Q3UGP9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc58Q3UGP9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc58Q3UGP9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms