Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rrp36Q3UFY0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rrp36Q3UFY0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Rrp36Q3UFY0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms