Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Puf60Q3UEB3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Puf60Q3UEB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Puf60Q3UEB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Puf60Q3UEB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms