Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pid1Q3UBG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pid1Q3UBG2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms