Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tbrg1Q3UB74 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tbrg1Q3UB74 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms