Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gtpbp6Q3U6U5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gtpbp6Q3U6U5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms