Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CenplQ3U3S3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CenplQ3U3S3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CenplQ3U3S3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms